Madrasah Tsanawiyah Amtsilati Bangsri
Madrasah Tsanawiyah Amtsilati Bangsri adalah salah satu sekolah formal dalam jenjang menengah di Pondok pesantren Amtsilati, setara dengan Sekolah Menengah Pertama (SMP). Pendidikan Madrasah Tsanawiyah ditempuh dalam waktu 3 tahun, mulai dari kelas VII sampai kelas IX.
Awal mula didirikannya Madrasah Tsanawiyah ini bermula ketika KH. Taufiqul Hakim menginginkan pendidikan formal untuk santrinya, sebagai suatu penunjang untuk masa depan santri di bidang pendidikan formal. MTs Amtsilati ini bermula dari berdirinya SMP IT Amtsilati yang didirikan pada tahun 2008. Seiring dengan berjalannya waktu pada tahun 2015 melalui masa transisi yang awalnya SMP IT Amtsilati berubah menjadi MTs Amtsilati Bangsri.
Surat Keputusan (SK) keluar pada tahun 2015 dan mulai melakukan kegiatan belajar dan mengajar di tahun berikutnya yaitu tahun 2016. Masyarakat pun sangat antusias sehingga pada tahun ajaran pertama siswanya mencapai kisaran 350-400 siswa.
Kurikulum Madrasah Tsanawiyah Amtsilati Bangsri sama dengan kurikulum Sekolah Menengah Pertama lainnya hanya saja pada MTs Amtsilati terdapat porsi lebih banyak muatan pendidikan agama Islam, yaitu meliputi Fiqih, Ushul fiqih, Aqidah Akhlak, Alquran-Hadits, Bahasa arab, Ke-NU-an dan Sejarah Kebudayaan Islam.